Manuel (11), Fiona (10) und Aaron (6) sind die "Flusspiraten"! Gemeinsam lösen sie die kniffligsten Fälle, die Köln zu bieten hat. Als Hauptquartier der Detektive dient die Penny Lane, das Hausboot, auf dem Manuel lebt. Unterstützung erhalten die Kinder von Kommissar Brummer, der zwar der felsenfesten Überzeugung ist, dass Kinder als Detektive total ungeeignet sind, aber immer wieder eines Besseren belehrt wird. Eines Tages in den Sommerferien kommt Fiona mit ihrem kleinen Bruder Aaron uneingeladen auf Manuels Boot. Fiona ist eine kleine Miss Marple und wittert überall Kriminalfälle. Weil die Mutter als Krankenschwester im Schichtdienst arbeitet, nimmt Fiona ihren kleinen Bruder überallhin mit. Der kann aber ganz schön nerven! Fiona findet Manuel und das Hausboot ziemlich spannend und versucht ihn zu überreden, mit ihr und notgedrungen auch mit Aaron ein Detektivbüro zu gründen. Manuel ist nicht sehr angetan von der Idee. Der Hilferuf einer alten Dame, deren Hund in den Rhein gefallen ist, lässt Fiona einen akuten Fall entdecken: Bei der Hunde-Rettungsaktion sieht sie einen riesigen Alligator im Fluss! Jetzt müssen die Kinder handeln! Sie beginnen mit den Ermittlungen und können schließlich einen skrupellosen Zoodirektor, der sich als krimineller Tierhändler bereichern will, überführen.